The SAVE 在英文中可用作存檔或拯救，在遊戲中是個雙關語。
存檔（The SAVE）是一種保存遊戲進度的能力。主角擁有一個存檔點。透過讀檔，角色們可以想起許多過去發生的事；就像Papyrus和Toriel所提到的，和你講話就像和老朋友說話一樣。
一旦玩家存檔，他們可以在遊戲菜單處讀檔。如果主角因HP歸零而死，遊戲會自動讀檔。
同樣相關的是重置和重啟遊戲的能力。這和讀取存檔對於角色的記憶有著一樣的效果。
什麼是「SAVE」
存檔和讀檔其實就是操縱時間線。當你讀檔或重置的時候，每個人都會被迫從現在的時間線移到一個新的時間線上。大部分的人幾乎不記得存檔讀檔之間發生了什麼事。如果有人在存檔後死亡，讀檔將會讓他們重生。
重置
重置选项能够在游戏菜单中被找到。它会移除储存在存档中的大部分信息，例如主角的LV和EXP;然而重置不会移除某些变量例如名字。和读档一样，游戏中的一些角色在重置后行为会有点不同。
真正的重置
真正的重置是一个能够在完成完美路线后获得的功能。它会彻底清除在存档文件夹中的所有信息，除了一个例外。
故事
花花曾經擁有存檔讀檔的能力，透過它從Alphys博士那裏注射的決心。然而，當玩家的角色進入地下世界時，更強的決心奪走了花花的存檔能力。然而，和其他NPC不同的是，無論你如何存檔或讀檔，它依然擁有一切記憶。如果你在廢墟的尾端寬恕Toriel後，讀檔殺掉她，你遇到花花時花花所說的話語將會改變；反之亦然。
然後，在中立結局吸取六個靈魂之後，花花的決心成功超越了玩家，搶走了玩家的存、讀檔權，並用以誤導玩家。它用了三個存檔點：一個是戰鬥的開始，當它還完全滿血的時候；另外兩個則是用來迷惑玩家。在花花失去它的力量後，玩家重新獲得了他們存檔／拯救的力量。
雖然乍看之下Sans似乎擁有存取能力，但實際上並非如此。他操縱時空的能力僅限於他當下的時間軸，而無法完全操縱時間軸並避免他自身的死亡，就像花花和玩家們所做的那樣。
Sans沒能保留記憶但他的科學研究讓他認識到時間操縱是可能的。他密切關注玩家（玩家被他們存檔讀檔卻能記住事件的能力影響了）他們對事件的反應顯得他們已經經歷過這些事件。他推測玩家有某種操縱時間的能力，並且在New Home的最終審判中他可能會告訴玩家，取決於玩家在那個點的反應。
玩家完成和平路線后可以執行真正的重啟（True Reset）。這會完全清除所有人（除了玩家）關於各個事件的記憶，比中立路線的重啟和普通的讀檔更徹底。
如果玩家完成了屠殺路線，世界和時間線會不復存在。但世界可以重啟。這會清空玩家的存檔文件，但他們存檔讀檔的能力不受影響。一個標記會讓遊戲記住玩家已經完成過屠殺路線。使用完美結局的True Reset無法清除它，而且它會影響以後玩家的所有存檔。
No SAVEs
玩家是可以選擇不存檔玩到所有結局的。這樣的話，在中立結局和和平結局，遊戲會承認玩家沒有存檔。
中立路線
花花會嘲笑主角沒有製造存檔文件。他照常使用存檔讀檔的能力。
在結尾的電話中，Sans可能會和玩家開玩笑，建議他們存檔。花花和主角的對話不受影響。
通關中立路線后，遊戲會重啟，不留任何存檔文件供玩家快速開始遊戲。
完美路線
如果你已經通過了一次中立結局，Alphys的支線任務會開啟，讓玩家可以遊玩完美結局。這些都可以不存檔完成。
在最終戰中，玩家可以覆蓋Asriel的存檔來打敗他。但遊戲會告訴玩家如果之前沒有存檔，他們就沒有足夠的力量這麼做。故事照常繼續，但遊戲會悄悄地自動保存，保護時間線在遊戲關閉后不消失。